Вильгельм фон Кюгельген родился в 1802 году в семье известного немецкого портретного художника Герхарда фон Кюгельгена. Его дядя, Карл фон Кюгельген, также был художником-пейзажистом и историком.
С 1818 года он изучал живопись в Дрезденской академии изящных искусств, где преподавал его отец. Основной работой В. Кюгельгена была живопись с религиозной тематикой.
После короткого путешествия в Рим вместе со своим двоюродным братом Тимоти Нефф, он вернулся на родину, где встретил свою жену, Юлию Круммахер. В 1828 году по личному заказу Николая I он нарисовал алтарную композицию в церкви Святого Олафа при помощи своего двоюродного брата Тимоти.
Долгое время он проживал в Балленштедте, одновременно участвуя в выставках своей alma mater. В 1933 году он получил должность придворного художника в Анхальт-Бернбурге, после чего поселился в своем собственном имении, где прожил до конца своей жизни.
Онлайн-продажа картин Вильгельма фон Кюгельгена представлена в галерее искусств Rios Art.